收集齐十四天书后，游戏将进入最终阶段。主角需返回家中查看桌面，会发现出现武林帖，提示前往嵩山参加武林大会。武林大会是通关前的关键剧情，需击败各派高手以证明实力。道德值高低会影响最终对战的对手类型，高道德值将面对十大善人，低道德值则需对抗十大恶人。胜利后可获得神杖，这是触发结局的必要道具。
取得神杖后，需前往霹雳堂（台湾岛）与孔八拉对话。交出神杖可获得绿钥匙，用于开启家中地道的机关。地道内设有十四天书陈列架，将天书放置于架上即可启动最终机关。部分复刻版本只需放置一本天书即可触发剧情，但原版需全部摆放。此环节设计呼应游戏主线目标，即集齐金庸武侠世界的核心象征物。
完成上述步骤后，游戏将进入最终战斗场景。正派路线需在华山之巅对抗十大善人组合，反派路线则在黑木崖与十大恶人决战。战斗难度较高，建议提前备足高级药品如黑玉断续膏，并确保主力武功如九阳神功、野球拳等已练至满级。战斗中需注意走位策略，优先击败治疗型角色如程灵素或攻击核心如郭靖。胜利后主角将成为武林盟主，完成穿越之旅。
游戏结局会根据道德值呈现不同动画，但核心流程不变。通关后仍可继续探索未完成的支线，如收集遗漏的武功秘籍或挑战隐藏BOSS。部分MOD版本如苍龙逐日在十四天书集齐后新增钓鱼岛决战日寇的剧情，但原版到此即告终结。这种设计既保持了经典作品的完整性，也为玩家预留了自由探索的空间。
